Il Comando Operativo (OPCOM) delle Forze nazionali è mantenuto dal Capo di Stato Maggiore della Difesa che, per questo, si avvale del Comando Operativo di Vertice Interforze (COVI).
Il Controllo Operativo (OPCON) delle unità nazionali partecipanti all'Operazione "Joint Enterprise" è assegnato a SACEUR che lo delega al JFC NAPLES ed al COMKFOR designato.
La cessione del controllo operativo all'Autorità NATO, non esaurisce la responsabilità nazionale e le connesse funzioni di Comando nei confronti delle unità italiane partecipanti all'Operazione "Joint Enterprise", per tutte le questioni di carattere amministrativo e disciplinare.
A tal fine, sono state definite le figure del National Contingent Commander (Comandante del Contingente Nazionale - NCC) coincidente con il Comandante del RC-W e dell'MSU.
