Il Comando Operativo (OPCOM - Operational Command) dell'Unità navale italiana è esercitato dal Capo di Stato Maggiore della Difesa.
Il Controllo Operativo (OPCON - Operational Control) dell'Unità navale italiana è esercitato dal Comandante del Comando Operativo di Vertice Interforze (COI).
Il Comando e il Controllo Tattico è esercitato dal Comandante della nave.
